上海食品经营许可证的办理流程通常包括以下步骤：

1. 准备相关资料并填写申请表。一般需要提供身份证、企业名称预先核准通知书、经营场地证明、人员健康证等相关材料。注意申请表应符合格式和内容的要求。
2. 将准备好的材料提交至食品药品监管部门，一般会受到食品经营许可申请予以受理的回执。
3. 现场核查，监管部门会安排监管人员，对申请人的经营场所进行核查，并实地核查。
4. 合格后，食品药品监管部门会出具食品经营许可证。

在完成上述流程后，申请人就可以持证继续经营食品了。

请注意，以上流程可能会根据具体情况有所变化，建议咨询相关部门获取具体信息。