在上海申请食品经营许可证需要准备以下材料：

1. 《食品经营许可申请书》；
2. 营业执照复印件或主体资格证明文件；
3. 法定代表人或拟任食品安全管理员的身份证明；
4. 经营场所平面布局图；
5. 周边环境图；
6. 相应食品安全管理制度文本；
7. 主要设施设备和接触食品及其原料的具证和承诺材料，如设备清单、设施及布局图等；
8. 食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验等保证食品安全的规章制度。

申请手续方面，申请人需要到当地市场监督管理局官网提交申请，并按照要求填写申请表，同时提交相关材料。在提交申请前，申请人需要确保申请材料中的复印件清晰，并加盖企业公章。然后，市场监督管理局会对申请进行审查，如果符合要求，就会准许申请者获得食品经营许可证。如果审查发现存在不符合要求的情况，市场监督管理局会告知申请者补正材料，完善申请手续。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能因各地要求而有所不同，建议咨询相关部门获取具体信息。