上海二类医疗器械经营备案的正常审批流程如下：

1. 准备相关材料：包括营业执照复印件、申请人的身份证复印件以及现场核查委托书等。
2. 在上海市食品药品监督管理局官网上，下载并填写《医疗器械经营许可证》申请表。
3. 将填写好的申请表及相关材料提交至相应部门，并递交相关申请。
4. 等待食品药品监督管理部门审核，一般需要5-6个月左右。
5. 审核通过后，领取《医疗器械经营许可证》。

在准备报审资料时，除了上述必备材料，还需要提供以下相关文件：

1. 公司章程，以及与经营相关的合同。
2. 经营地、库或者其他场所的场地布局图、设备清单等。
3. 质量管理文件（包括质量管理制度、岗位职责、采购、验收、储存、养护等规章制度）。
4. 技术人员的学历、职称证书以及相关的工作经验证明。
5. 组织机构及售后服务管理制度等相关文件。
6. 其他必要的文件。

注意：不同的区域或许有些许差别，具体材料可以咨询当地相关部门。

在经营过程中需定期做申报或变更等相关工作，以保证经营的合法性。具体的操作流程和所需材料可能会因地方政策变化而有所不同，建议及时关注相关部门的信息更新。