在上海新办二类医疗器械备案需要准备以下资料和步骤：

所需资料：

1. 医疗器械备案申请表；
2. 营业执照复印件；
3. 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明复印件；
4. 临床备案场地平面图；
5. 产品技术要求复印件或产品说明书。

办理步骤：

1. 准备上述所需资料，并填写医疗器械备案申请表；
2. 将申请表连同其他材料提交给上海市药品监督管理局；
3. 等待审核结果，一般需要30个工作日左右。

在完成备案后，您将获得一个备案编号，该编号可用于宣传推广您的产品。同时，请确保您的产品符合国家相关法律法规，并在进行临床试验、宣传推广时遵守相关规定。如有疑问，建议咨询专业人士。