申请房地产经纪备案需要准备一系列的文件和流程，具体如下：

1. 公司营业执照副本、经办人身份证明、机构介绍信（或法定代表人委托合同）。
2. 经营场所使用证明，包括产权证明、租赁合同原件或复印件，新注册公司需要提供公司章程。
3. 所有从业人员的房地产经纪人证书复印件，以及身份证原件。如果单位员工人数多于三人，需要增加《备案登记表》。
4. 机构黑名单相关证明文件（如无就是否被列入黑名单）。
5. 房地产经纪服务合同、项目信息登记表（电子版即可）。
6. 工商部门出具的公司名称证明文件（公司名称尚在保留期内的不予备案）。
7. 申请表格，包括但不限于《房地产经纪机构备案登记表》、《房地产经纪机构信息采集表》、《分支机构设立申请表》等。

完成上述文件准备后，您需要向上海市住房城乡建设管理委提出申请，并提交所有需要的文件和材料。在提交申请后的十个工作日内，相关部门将审核申请是否符合相关规定，并对经营场所、人员、资质证书等进行实地核查。如果申请通过审核，那么相关部门会颁发备案证明，这时申请者就可以正式完成上海公司申请房地产经纪备案的相关流程了。

以上流程仅供参考，建议您在申请前向相关部门进行咨询以确保顺利完成申请。