上海二类医疗器械备案办理条件主要有以下两点：

1. 企业需要是境内依法设立的企业法人。
2. 企业具备按照国家有关医疗器械生产的条件和要求，生产第二类、第三类医疗器械的能力。

办理上海二类医疗器械备案审批全流程所需资料如下：

1. 工商营业执照和组织机构代码复印件；
2. 生产设施、设备目录；
3. 质量管理制度、程序文件目录；
4. 相关专业技术人员资格证书或证明文件；
5. 临床验证方案批件；
6. 拟申请产品的主要生产工艺流程与相关说明；
7. 其他需要提交的文件。

具体的办理流程如下：

1. 企业向上海市药品监督管理局提出申请；
2. 区局根据有关法律法规的规定，对申请资料进行审查，必要时进行现场核查；
3. 审核通过后，报市局备案，市局备案同意后，发放备案凭证。

需要注意的是，整个备案过程需要提交的资料较多，需要企业按照要求准备。同时，医疗器械的生产需要严格遵守相关法律法规，确保生产过程的规范性和产品安全性。