上海初次申请医疗器械经营许可证所需资料和流程如下：

**所需资料**：

1. 营业执照复印件。
2. 组织机构代码证复印件。
3. 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明复印件。
4. 相关人员职称证复印件。
5. 房屋产权证明或租赁协议复印件。
6. 科室设置平面图。
7. 经营设施、设备的清单。

**流程**：

1. 准备相关资料，提交到上海市药品监管局。
2. 药品监管局审核资料，并实地检查。
3. 如果检查合格，他们会颁发《医疗器械经营许可证》申请受理通知书。
4. 之后是审查部内部综合审评，通过后会公示通知。
5. Zui后是取证公告，无异议后，即可领取《医疗器械经营许可证》。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能根据实际情况有所调整，建议咨询相关部门获取准确信息。