上海办理第二类医疗器械经营备案凭证的指南和所需条件如下：

一、办理指南：

1. 企业需要向上海市市场管理局提出申请，并按照要求提交相关资料，包括企业名称、地址、法定代表人、负责人及其身份证件等。
2. 填写备案凭证申请表，该表格可以在上海市市场管理局guanfangwangzhan上下载，或者向其窗口咨询。

二、所需条件：

1. 企业必须持有营业执照和相关许可证。
2. 企业有固定的经营场所，并能够满足经营需要。
3. 企业有健全的医疗器械管理制度，包括采购、验收、储存、养护、销售等环节。
4. 企业有相应的设备、设施和检测手段，能够满足医疗器械经营的需要。

三、所需资料：

1. 第二类医疗器械经营备案表（原件1份，加盖企业公章）。
2. 营业执照复印件（原件1份）。
3. 法定代表人、企业负责人身份证明复印件（原件1份）。
4. 代理人身份证、企业委托书原件各1份。
5. 经营场地、库房地址的证明文件，以及租赁合同复印件（原件1份）。
6. 经营设施设备证明文件（原件1份）。
7. 质量管理人员身份证明原件及复印件各1份。
8. 其他证明文件：如第三方检测报告等。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能因实际情况而有所不同，建议咨询相关部门获取准确信息。