上海第二类医疗器械经营备案凭证的办理地点在上海市各区市场监督管理局，具体地址可以在上海市药品监督管理局官网查询。

申请条件如下：

1. 营业执照经营范围包含医疗器械相关内容，或者有医疗器械经营企业许可证；
2. 拥有符合相关法规规定的经营场所和仓库；
3. 有与经营规模和经营范围相适应的注册资金；
4. 有与经营的医疗器械相适应的质量管理制度与质量管理人员的药学技术人员或其他技术人员；
5. 有与经营的医疗器械相适应的设备、仓储设施；
6. 有对医疗器械质量负责的质量管理制度；
7. 能够保证经营过程的正常运作和经营质量管理体系的有效运行；
8. 符合相关法规规定的其他条件。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能因实际情况而有所不同，建议咨询当地市场监督管理局获取更多信息。