在上海申请房地产经纪机构备案，需要按照以下步骤进行：

1. 准备申请材料：房地产经纪机构需要准备以下材料：企业法人营业执照复印件（如果机构为法人企业）、房地产经纪人证书复印件、机构发展计划和业务开展计划、机构地址租赁合同或产权证明复印件、从事房地产经纪业务所需的有关设备、房屋和资金的证明材料等。同时，还需要准备申请备案报告书，包括机构名称、机构地址、法定代表人姓名及有效身份证明复印件、经营范围等内容。
2. 向所在区县房地产交易中心业务受理窗口提交申请材料，其中需携带加盖房地产经纪机构公章和法定代表人签字的相关材料。
3. 等待审核结果。如果申请材料不齐全或者不符合要求，窗口办公人员会当场一次告知需要补正的全部内容，并给予合理补救期限。如果申请成功，将获得《上海市房地产经纪机构备案证明》。

以上步骤仅供参考，具体流程和所需材料可能因实际情况而有所不同，建议咨询相关部门获取具体信息。