上海食品经营许可证网上申报流程如下：

1. 登录上海市食品药品监督管理局官网，没有账号的需要注册一个账号。
2. 登录成功后选择“食品经营许可证核发”选项。
3. 根据自身的情况进行资料填写，包括许可证编号填报、标示、食品类别等。
4. 将申报的资料提交给审批部门，包括营业执照复印件、经营场所平面图、负责人身份证复印件等。
5. 等待审核结果，如果审核通过，就可以领取食品经营许可证。

具体申报资料如下：

1. 营业执照复印件或经营者身份证。
2. 经营场所平面布局图。
3. 经营者或者从业人员的健康证。
4. 食品添加剂的使用手续。
5. 周边环境图。
6. 食品安全管理制度，包括采购、储存、加工、销售等制度。

以上信息仅供参考，不同时期申报需要的资料可能有所不同，应以官网通知为准。