上海医疗器械经营许可证申请流程及材料如下：

流程：

1. 准备相关材料：营业执照复印件、申请表、法定代表人身份证明等。
2. 将材料提交至上海市药品监督管理局进行审核。
3. 等待审核结果，如果申请事项依法不需要设行政许可的，应当及时告知申请人不受理。
4. 审核通过后，领取医疗器械经营许可证。

材料：

1. 上海市医疗器械经营企业许可证申请表。
2. 企业营业执照复印件。
3. 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明、学历或者职称证明复印件。
4. 组织机构与部门设置说明。
5. 经营范围、经营方式说明。
6. 经营设施、设备目录。
7. 经营质量管理制度、工作程序等文件目录。
8. 办理人授权证明。

注意：不同类型和规模的医疗器械经营企业，所需材料可能略有不同，建议在申请前仔细阅读相关规定，并咨询相关专业人士。

具体流程和材料可能会根据上海当地政策变化，建议咨询相关部门获取准确信息。