上海新办医疗器械三类经营许可证的具体要求和资料如下：

1. 准备相关负责人身份证、学历、职称证书及劳动合同，办理医疗器械经营许可证还需要提供公司的营业执照。
2. 医疗器械产品注册证书、生产许可证及产品质量标准，可能还需要产品的说明书和标签样稿。
3. 具体要求还要参考《医疗器械监督管理条例》及《医疗器械经营监督管理办法》。
4. 经营场所的租赁合同和房屋产权证明。
5. 医疗器械经营企业的安全管理制度，包括质量管理制度、安全管理制度等，必要时申办者可以从外部引入咨询机构协助建制。
6. 一个干净的经营场所的布局图和配置图，注明经营设备摆放位置和相关的安全操作规程。
7. 在重要岗位培训相关资料留存。具体如库管员和销售人员的培训记录等。

在满足以上基础条件的情况下，再参考自身具体情况进一步细致的准备工作，以申办许可证过程中所需的具体资料。建议您查询相关网站或者咨询专业人士，以获得更具体的信息和建议。