上海新办二类医疗器械经营备案凭证的流程可以大致分为以下几个步骤：

1. 准备相关材料：包括营业执照复印件、法人代表身份证复印件、授权书、相关产品信息资料等。请注意，具体所需材料可能会因实际情况而有所不同，zuihao能向相关部门进行咨询。
2. 在上海市场监督管理局网站上进行备案登记，填写相关表格和信息。
3. 提交材料进行审核，可能需要面对现场核验。
4. 成功获得批准后，进行备案凭证的下载和打印。

全包资料主要包括：

1. 公司营业执照复印件。
2. 法人代表身份证复印件。
3. 授权书。
4. 相关产品信息资料。
5. 填写完整的医疗器械经营备案表和承诺书。

请注意，在准备上述资料时，zuihao能咨询相关专业人士，以确保所有资料的准确性、完整性和合规性。此外，具体的办理流程和所需材料也可能有所变化，建议在申请前向相关部门进行咨询。