上海申请二类医疗器械备案需要满足以下条件：

1. 依法设立的公司。
2. 有与经营第二类医疗器械相适应的经营场所，以及符合经营要求的仓储场所。
3. 有与经营第二类医疗器械相适应的专业人员。
4. 有与经营第二类医疗器械相适应的经营管理制度。

申请流程如下：

1. 向所在地设区的市级负责药品监督管理的部门提出申请。
2. 提交相关材料，包括备案申请表、证明公司符合条件的证明文件等。
3. 提交完成的相关材料，等待审核结果。

具体流程可能因地区规定略有不同，建议到相关部门进行咨询和了解相关政策。同时，还需要注意以下几点：

1. 准备齐全上述材料的同时，根据实际情况，准备其他经营许可所需材料。
2. 遵守国家药品安全法规和相关政策，确保经营行为符合法规要求。
3. 二类医疗器械实行备案管理，取得备案后即可开展相关经营活动。经营活动结束后，记得将相关材料及时归档留存。

以上信息仅供参考，建议咨询专业人士或相关部门获取具体信息。