申请上海三类医疗器械经营许可的条件与流程如下：

条件：

1. 符合医疗机构或者企业法人单位的营业条件，符合医疗器械监管的相关法律法规。
2. 拥有与经营范围相匹配的资质证明材料，包括营业执照、组织机构代码证、税务登记证等。
3. 拥有与经营规模和经营范围相适应的质量管理制度、安全管理制度和岗位操作规程等。
4. 拥有符合相关法规要求的储存设施，包括仓库地址、面积、设施设备等。
5. 拥有符合相关法规要求的办公场所，包括办公地址、面积、设施设备等。
6. 符合上海市食品药品监督管理局的其他规定。

流程：

1. 准备申请材料，包括营业执照、组织机构代码证、税务登记证、仓储设施、办公场所证明等。
2. 向上海市食品药品监督管理局提交申请，并确保申请材料真实、完整、合法、有效。
3. 等待审核，审核期间需要配合现场核查。
4. 如果审核通过，将获得三类医疗器械经营许可证。

具体流程可能根据实际情况有所变化，建议咨询相关部门获取准确信息。