在上海申请二类医疗器械经营备案，可以按照以下步骤进行。

1. 确定公司是否具备相关资质：二类医疗器械经营备案的申请需要以企业的名义进行，因此，公司必须具备相关的资质和营业执照。
2. 准备备案所需的材料：包括公司的基本情况介绍、经营范围说明、经营地址证明等。同时，需要准备医疗器械经营许可证申请表、经营质量管理规范文件以及相关人员的身份证件。
3. 提交申请材料：将所有材料准备齐全后，按照要求提交到相关部门。
4. 接受审核：等待相关部门对申请材料进行审核。
5. 完成备案：如果审核通过，相关部门会颁发二类医疗器械经营许可证。

如果需要代办，则需要以下材料：

1. 企业营业执照复印件。
2. 组织机构代码证复印件。
3. 授权委托书（需包含被授权人的姓名、身份证号、授权事项和授权期限等）。
4. 经办人身份证复印件。
5. 申请表格（需填写完整并加盖公章）。

请注意，具体流程和所需材料可能会因地区而异，因此zuihao在申请前咨询当地相关部门或机构。同时，需要确保所有提交的材料真实、准确、合法。

以上信息仅供参考，希望对你有所帮助。