上海二类医疗器械许可证的办理流程和所需资料如下：

流程：

1. 准备相关资料，包括企业法定代表人、企业负责人、质量负责人的学历证明、职称证明等。
2. 递交申请材料，到上海市市场监督管理局官网中选择线上申请。
3. 按照要求完成检查，符合后，上海市市场监督管理局会在一窗通上出准许受理通知书。
4. 等待审核结果，并支付200元费用。
5. 办结后，按照上面的邮寄地址或者自行前往市场监督管理局领取医疗器械经营许可证。

所需资料：

1. 公司营业执照原件和复印件。
2. 公司公章（包括销售合同章、财务章、合同专用章等）。
3. 填写医疗器械经营企业许可证申请表。
4. 提交企业符合条件的证明材料，例如公司人员学历证明等。
5. 提交公司医疗器械经营范围核定材料等。

请注意，医疗器械许可证的办理需要严格遵守相关法律法规和标准，确保产品的安全和有效性。在办理过程中，如有疑问，建议咨询相关专业人士。