上海医疗器械经营许可证的办理流程和所需材料如下：

办理流程：

1. 准备相关材料：营业执照复印件、公章等。
2. 提交材料至上海市市场监督管理局，即原食品药品监督管理局。
3. 等待审核。
4. 审核通过后，领取申请表并加盖红色公章。
5. 按照通知内容，领取医疗器械经营许可证。

办理材料：

1. 上海市医疗器械经营企业许可证申请表。
2. 营业执照复印件。
3. 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明、学历或者职称证明复印件。
4. 组织机构与部门设置说明。
5. 经营范围、经营方式说明（根据实际情况）。
6. 经营设施、设备目录。
7. 经营质量管理制度、工作程序等文件目录。
8. 经办人身份证明复印件。
9. 房屋产权证明或租赁协议复印件。

注意：以上材料需要加盖企业公章。如果需要代办，需要提供代办人的身份证复印件。以上材料可能会根据实际情况有所变化，建议办理前咨询相关部门。

以上信息仅供参考，详细内容建议咨询相关部门获取。