办理上海医疗器械经营许可证，需要准备以下材料和流程：

一、所需材料：

1. 营业执照复印件。
2. 申请人的身份证原件及复印件。
3. 法定代表人身份证明。
4. 房屋产权证复印件及经营场地证明。
5. 相关部门批准设立的证明文件。
6. 医疗器械产品注册证书、供应商资格证明等其他材料。
7. 申请填写《医疗器械经营许可证》申请表，并加盖企业公章。
8. 其他需要提交的相关材料。

二、具体流程：

1. 准备上述材料，并填写申请表格。
2. 将申请表格和相关材料提交给工商部门。
3. 等待相关部门审核，可能需要几个工作日的时间。
4. 如果审核通过，将获得《医疗器械经营许可证》。

此外，还需要注意，医疗器械经营许可证的办理需要根据具体的经营产品来确定条件，具体条件可以查询上海市食品药品监督管理局官网获取。另外，在申请过程中，如有任何疑问，可以咨询上海当地的工商部门或者相关机构。

另外，自2022年1月1日起，医疗器械生产经营许可实行电子证照，医疗器械经营许可证电子证照和纸质证书具有同等效力。办理医疗器械经营许可证需要按照相关法规进行申请，审批程序也需要在规定时间内完成。

总的来说，具体步骤可能会因地区而异，建议前往上海当地的工商部门或者相关机构获取具体信息。