注册上海二类医疗器械公司经营备案的步骤和所需资料如下：

步骤：

1. 准备相关材料：包括公司执照、法定代表人身份证、代理人身份证、加盖鲜章和无地址无园区无工会注册的承诺书等。
2. 向所在地市场监督管理局提出申请并递交材料。
3. 等待审批，审批通过后，会收到准予许可决定书及营业执照。
4. 领取医疗器械经营许可证。

所需资料：

1. 公司全套资料，包括公司章程、股东会或董事会决议、股权转让协议等。
2. 申请人的身份证复印件，及加盖鲜章的代理人身份证原件。
3. 营业执照正本及全部副本。
4. 经营场地（需要提供房屋租赁合同、协议）及经营场所平面布局图。
5. 备案人加盖印章和法定代表人签字的质量管理组织架构图，并注明质量管理组织、岗位职责、联系电话等。
6. 其他相关材料和文件（如经营销售第三类医疗器械）。

注意：上述所有材料都需要加盖公司红章并按照实际情况提供。在申请过程中，可能需要参加培训或进行实地检查。具体要求和流程请咨询专业人士。

以上内容仅供参考，建议咨询相关专业人员获取具体信息。