上海办理食品经营许可证的流程和所需资料清单如下：

流程：

1. 申请，申请人向政务服务大厅工商质监窗口提出申请，提交申请材料。
2. 受理，窗口工作人员当场核验申请材料，根据下列不同情况分别作出处理：
（1）申请事项依法不需要取得食品经营许可的，即时告知申请人不受理；
（2）申请事项不属于本部门职权范围的，即时作出不予受理的决定，并告知申请人向有关行政机关申请；
（3）申请材料存在可以当场更正的错误，允许当场更正；
（4）申请材料不齐全或者不符合要求，应当场或者在五日之内一次性告知申请人需要补正的全部内容，逾期不告知的，自收到申请材料之日起即为受理。
3. 审查与决定，食品药品监督管理部门根据需要进行现场核查。
4. 领取结果。

所需资料清单：

1. 经营者的身份证原件及复印件。
2. 经营者照片两张。
3. 经营场地证明，如产权证复印件、房屋租赁合同等。
4. 经营者签署的食品经营许可证申请书。
5. 委托书以及被委托人的身份证复印件。
6. 食品安全管理制度文本。
7. 相关的设备布局、工艺流程、操作流程、风险控制等说明文件。

以上信息仅供参考，具体流程和所需资料可能会根据上海当地政策进行变化。建议办理前咨询相关部门。