上海医疗器械经营许可证的申报资料和网上操作步骤如下：

一、申报资料

1. 《医疗器械经营企业许可证申请表》和《企业名称预先核准通知书》复印件。
2. 经营场地、仓库场所的证明或者产权证明。
3. 经营设施、设备的证明或者产权证明、平面图。
4. 法定代表人、企业负责人、质量管理人员的相关证件（复印件）。
5. 相关部门（需要省级以上药品监管部门）的审核批准文件。
6. 医疗器械注册证、产品合格证明文件等有关材料。
7. 管理制度的相关材料。
8. 其他需要提交的材料。

二、网上操作步骤

1. 进入上海食品药品监督管理局网站，找到“行政服务”栏，进入医疗器械许可管理界面。
2. 进入后，根据界面提示，填写相关申请信息。填写时要确保申请信息真实有效，全部填写完毕后提交即可。
3. 提交成功后，会在两天后领取新的许可证。

注意，如果之前没有办理过相关许可证，在申请医疗器械经营许可证时，还需要进行前置审批。此外，医疗器械的经营环境要求非常严格，需要根据当地的相关规定来执行。因此，在申请之前，建议咨询相关专业人士或机构，以确保申请过程的顺利进行。