办理上海二类医疗器械备案的流程和材料须知如下：

流程：

1. 准备相关材料：包括《第二类医疗器械经营企业备案表》；企业法人代表身份证复印件；营业执照复印件；相关人员的身份证、学历、职称证明复印件等。
2. 向上海市市场监督管理局申请备案，提交材料。
3. 等待市场监督管理局审核材料。
4. 审核通过后，领取二类医疗器械经营备案证明。

注意：整个过程需要的时间可能会因为具体的情况而变化，可能需要一到五个工作日制。具体的时间和流程可能会因为地区和具体要求而有所变化。

材料：

1. 加盖企业公章和法定代表人签字的企业法人代表身份证复印件、营业执照复印件。
2. 加盖企业公章和法定代表人签字的企业负责人的身份证复印件、学历、职称证明复印件及其它相关证件（如职称证、毕业证、专业技术资格证等）。
3. 加盖企业公章的办公场地证明（房产证复印件或租赁合同等）。
4. 加盖企业公章的拟负责人近期免冠半身照片。

希望这些信息对你有帮助，更多内容建议咨询上海市市场监督管理局相关工作人员。