上海二类医疗器械备案详细流程如下：

1. 准备相关材料：包括《第二类医疗器械经营企业备案表》（一式两份）、《企业名称预先核准通知书》以及申请人的身份证等证件。
2. 在上海市场监督管理局官网填写并提交《医疗器械经营备案申请表》。
3. 准备相关材料，包括企业工商营业执照复印件、公司章程复印件、法定代表人或者负责人身份证明等。
4. 提交材料后，等待审核结果，领取《第二类医疗器械经营备案凭证》。

在线提交材料的注意事项：

1. 提交的材料必须加盖企业公章，未加盖公章的材料将不予受理。
2. 申请材料应完整、真实、准确、规范，不得随意涂改。
3. 申请材料格式请使用PDF格式，每个材料注明姓名和申请事项。
4. 申请成功后，可以在系统查看备案凭证，并下载打印《第二类医疗器械经营备案表》一式两份。

具体操作细节和建议，您可以在上海市场监督管理局官网查看相关文件和指南，或者咨询官方机构以获取更准确的信息。