上海二类医疗器械备案流程包括以下步骤：

1. 准备材料：准备《第二类医疗器械经营备案申请表》和《承诺书》等材料。
2. 提交申请：将申请材料提交给上海市市场监督管理局，具体包括备案人身份证明、经营场所地址、经营场所平面图、负责人的身份证证明等。
3. 审核材料：上海市市场监督管理局将对提交的申请材料进行审核，确保材料齐全、符合法定形式。
4. 领取证书：如果申请材料通过审核，上海市市场监督管理局将颁发《医疗器械经营备案凭证》。

在审批过程中，审批部门可能会查看以下材料：

1. 备案人的身份证明和经营场所产权证明等资料。
2. 医疗器械经营管理制度和质量管理文件。
3. 医疗器械产品注册证书、产品技术要求、合格证明和其他相关资料。
4. 经营场所平面图、布局图以及安全设施资料。
5. 负责人的身份证证明和培训证明等资料。
6. 其他相关材料，如法律法规规定需要提交的其他材料。

这些材料仅供参考，建议咨询相关专业人士获取更准确的信息。