上海二类医疗器械经营备案一网通办材料清单及审批流程如下：

材料清单：

1. 主体资格证明：公司的营业执照或其他有效证明文件。
2. 法定代表人身份证明：身份证或其他有效证明文件。
3. 申请表格：下载并填写完整的《医疗器械经营企业许可证申请表》和《承诺书》。
4. 场地证明：提供经营场所的场地证明，包括产权证明或租赁合同。
5. 设施设备证明：提供相关设施和设备的说明及相关证明。
6. 制度文件：提供质量管理体系相关文件和制度。
7. 其他相关材料。

审批流程：

1. 网上注册账号并填写相关信息进行申请。
2. 准备齐全上述所需材料。
3. 将材料上传到平台，并提交申请。
4. 等待审批：平台会进行资料审核，并通过电话、现场核查等方式进行审批。
5. 审批通过后，会发放二类医疗器械经营备案凭证。

以上信息仅供参考，具体材料和流程可能因地区而异，建议咨询相关部门获取具体信息。