办理上海医疗器械经营许可证的流程和资料如下：

流程：

1. 准备相关材料：包括营业执照、组织机构代码证、税务登记证、法定代表人、负责人和质量管理人员的身份证、学历、职称证书复印件、注册地址材料等。
2. 向相关部门提出申请：可以选择在线申请或者窗口办理，在线申请可登录上海市市场监督管理局官网进行在线办理。
3. 提交申请材料：预审通过后，按照预约的时间和地点将申请资料提交到对应窗口。
4. 接受现场审查：在规定时间内到该部门进行现场审查。
5. 领取证书：审查通过，领取《医疗器械经营许可证》。

资料：

1. 拟办企业承诺书。
2. 证明企业符合经营条件的相关资料。
3. 拟办企业质量管理人员的身份证、学历、职称证书复印件、个人简历和体检证明材料。
4. 拟办企业注册地址和仓库地址的证明资料，包括产权证明/租赁协议和出租方的证明等。
5. 质量管理规范文件，包括组织架构、岗位职责、进货查验、贮存、销售、出库、质量跟踪、投诉处理等文件。
6. 其他必要的材料，如营业执照和组织机构代码证。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能根据实际情况有所调整，建议咨询相关部门获取具体信息。