上海设立二类医疗器械备案的操作步骤如下：

1. 搜索上海市人民政府官网，在官网页面中找到“政务公开”-“在线办事”，然后选择“医疗器械”服务专栏。
2. 选择“二类医疗器械备案”，点击在线办理，根据实际情况选择对应的备案类型。
3. 填写申请表，在操作步骤3至步骤6中，需要注意查验并确认产品描述，包含申请企业名称和申请事项所在省（区、市）明确具体经营场所、联系电话、邮箱等内容。
4. 上传附件材料，产品描述填写完毕后，填写备案事项信息并上传二类医疗器械备案申请材料（包括委托书、营业执照等）。
5. 预览提交，确认申请表单内容无误后，点击提交。
6. 提交成功，等待官方审核。

上海设立二类医疗器械备案所需资料如下：

1. 《第二类医疗器械经营备案申请表》。
2. 营业执照和法人登记证书复印件。
3. 经营场所、库房地址的地理位置图、平面布局图。
4. 委托办理的应提交《委托书》。
5. 其他相关资料，如产品质量管理制度、售后服务制度、相关人员的资质证明等。

请注意，具体要求可能会因地区而异，建议在准备材料时仔细核对官方规定。