二类医疗器械经营备案代办的流程和资料清单如下：

流程：

1. 准备相关资料：营业执照、法人身份证明、授权书等文件。
2. 向相关部门提交资料，填写申请表。
3. 等待审核，如果审核通过，则正式受理。
4. 备案成功后，领取第二类医疗器械经营备案证明。

资料清单：

1. 第二类医疗器械经营备案表；
2. 营业执照复印件；
3. 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明、学历或者职称证明复印件；
4. 经营范围、经营方式说明；
5. 经营场所、储存设施、设备情况描述及相关证明材料；
6. 从事第二类医疗器械经营人员聘用情况介绍及学历证明复印件；
7. 制度文件及质量管理文件；
8. 采购、收货、验收、仓储配送、售后服务等程序文件；
9. 质量管理相关记录表格。

请注意，不同地区可能需要的资料会有所不同，建议在申请前咨询当地相关部门。办理时需注意资料的完整性和真实性，相关部门的审核可能会严格，以免出现不必要的麻烦。