在上海办理三类医疗器械经营许可证的流程和所需资料须知如下：

一、办理流程：

1. 准备相关材料：包括营业执照、法定代表人、企业负责人的身份证等，大概需要1-2天。
2. 提出申请：向所在地的市级食品药品监督管理部门提交申请，可以委托代理人办理，准备好委托书等材料。
3. 提交材料：申请材料齐全且形式符合要求的，食品药品监督管理部门会受理申请，并组织专家进行审查。
4. 审核检查：会作出准予许可或不予许可的决定。如果准予许可，会颁发许可证。

二、注意事项：

1. 需要提前准备电子营业执照和申请表格，申请表格zuihao在网上向相关部门下载。
2. 现场有人员要求穿戴工作服等，需要严格遵守。
3. 审查过程中有实地核查环节，可能会产生相应的费用。

三、所需资料：

1. 营业执照复印件。
2. 企业负责人毕业证、身份证复印件。
3. 直接接触药品人员身份证复印件及上岗证。
4. 房屋产权证明或租房合同复印件（注册地址）。
5. 申请材料真实性自述文件。
6. 申请表电子版（含企业信息表）。
7. 医疗器械经营许可证申请表原件。
8. 申请网络经营的，提交网站证明复印件。
9. 其他证明文件。

请注意，办理流程和所需材料可能会根据实际情况有所变化，建议办理前咨询相关部门，确保顺利办理。