上海办理二类医疗器械备案的流程与具体要求如下：

流程：

1. 准备相关材料：包括营业执照、法定代表人身份证明、代理人身份证证明等。
2. 向所在地设区的市级负责药品监督管理的部门提出申请，并递交相关材料。
3. 等待审核，审核通过后等待审批。
4. 领取二类医疗器械备案表和证书。

具体要求：

1. 营业执照复印件、法定代表人身份证明、代理人身份证证明等。
2. 产品电子文档，包括产品名称、型号、规格、生产工艺等。
3. 产品生产流程，包括关键质量控制点的操作要求。
4. 产品说明书样稿。
5. 企业须保证申请材料真实、完整、符合法定形式，承诺其备案产品在上市销售前不涉及侵犯他人知识产权。
6. 需要时，设区的市级负责药品监督管理的部门可指派技术专家进行现场审核并出具书面意见，审核中发现的问题需按要求当场指导备案单位整改，并向市级负责药品监督管理的部门报告整改情况。

以上流程及具体要求供参考，请以实际情况为准，并及时关注相关政策变化。