上海二类医疗器械备案网上申报资料需要包含以下内容：

1. 境内责任人身份证信息、联系电话，办理电子签章，并确保电子签章与提交的申请材料中的联系人信息一致。
2. 企业工商营业执照正、副本，标明经营范围必须涵盖第二类医疗器械（需要原件高清照片）。
3. 公司标志及注册证号/许可证编号（包括可变信息部分）；使用说明书、标签、销售委托书（加盖公章和法定代表人签名）。

上海二类医疗器械备案审批流程如下：

1. 准备相关材料，在网上或到现场提交。
2. 行政审批中心药械科窗口（或网上）审核材料。
3. 符合条件的，领取第二类医疗器械经营备案表。
4. 填写备案表并加盖企业公章。
5. 配备两名以上人员到药监部门进行培训并取得合格证明。
6. 完成公司网站及相关售后人员备案。
7. 提交备案表和相关材料，等待市局（物品捐赠）或区县局（直接购买）审批。
8. 市局或区县局审批通过后，领取备案凭证。

需要注意的是，以上流程可能会根据实际情况有所变化，具体请参考官方信息。