在上海办理二类医疗器械经营备案，需要按照上海市食品药品监督管理局的步骤进行。必备资料和流程如下：

一、必备资料

1. 二类医疗器械经营备案表1份（加盖公司公章）和电子档。
2. 营业执照复印件。
3. 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明复印件。
4. 经营范围、经营方式说明。
5. 经营场所、仓库地址及租赁合同复印件。
6. 符合要求的证明文件，如合格证明文件、检测报告等。
7. 验收合格证明。

二、流程

1. 准备相关材料：包括备案表、营业执照、身份证明等。请注意，表格应用黑色或蓝黑色墨水笔填写，字迹清晰可见，不得涂改。
2. 向所在地各区食品药品监督管理局提出备案申请，并将所需材料提交其审查。
3. 等待食品药品监督管理局对申请进行审批，并确保材料完整。
4. 如果材料完整且审批通过，食品药品监督管理局会出具备案凭证，您将可以在网上查询并打印。

完成以上步骤后，您就可以成功在上海办理二类医疗器械经营备案了。请注意，具体流程可能因时而异，建议申请者详细咨询当地的食品药品监督管理局，了解最新的政策和要求。

希望以上信息对您有所帮助，如果您还有其他问题，欢迎告诉我。