注册上海二类医疗器械公司新办备案所需资料与手续如下：

1. 公司名称：准备3-5个公司名称，以便工商核名。
2. 注册资金：认缴注册资金，无需验资。
3. 公司地址：真实有效的地址证明，如租赁合同等。
4. 股东信息：提供股东身份证照片或复印件，以及占股比例。
5. 公司经营范围：根据公司业务情况，填写公司经营范围。
6. 拟定公司名称：医疗器械备案凭证的名称要求。
7. 相关材料：与拟定公司名称相关的证明材料，如产品备案证等。

注册上海二类医疗器械公司的备案流程如下：

1. 向上海市市场监督管理局提交申请，并按照要求提供相关资料。
2. 提交资料后，等待市场监督管理局受理。
3. 审核通过后，领取医疗器械经营备案凭证。

此外，还需注意以下几点：

1. 医疗器械经营企业必须要有相关设施和设备，确保能够满足医疗器械的储存、陈列、销售等要求。
2. 医疗器械经营企业必须要有完整的记录和档案，包括购货、验收、储存、销售等记录，以及相关的票据和凭证。
3. 医疗器械经营企业应当遵守国家有关法律法规的规定，不得销售假冒伪劣、过期失效、无合格证明、无生产日期的产品，不得销售无合法证明的进口医疗器械。

总的来说，如果您准备开设一家二类医疗器械公司，需要按照相关法规准备资料与手续，并确保符合相关规定和要求。