上海医疗器械经营许可证新办的流程和所需资料如下：

流程：

1. 准备并提交医疗器械经营企业许可证申请资料。
2. 市药监局人员审查资料是否齐全，如果资料不齐需要补齐，审查通过后受理申请。
3. 实施产品技术审评。
4. 药监局人员现场核查，检查企业的经营条件是否符合医疗器械经营要求。
5. 领取医疗器械经营许可证。

所需资料：

1. 营业执照复印件。
2. 申请人的身份证原件及复印件。
3. 经营场地证明文件（租房合同、产权证，如果自有房屋则提供产权证）。
4. 法定代表人或者负责人的身份证复印件及一寸近期免冠照片。
5. 质量管理人身份证明及学历证明。
6. 其他相关企业或者人员材料。

特别提醒，所提供的证件和材料都需要加盖企业公章，并且每个地方的政策可能略有不同，建议在申请前仔细了解并准备齐全相关材料。同时，建议咨询相关专业人士，以确保申请过程无误。