上海房地产经纪备案申请流程如下：

1. 登录上海市房地产经纪行业管理信息平台网站，下载并填写《上海市房地产经纪机构备案登记表》。
2. 将申请表格、企业证件、劳动合同、人员证件、合同或协议等相关资料扫描件上传至该平台系统，并完成在线提交。
3. 等待行业协会对申请材料进行审核，同时缴纳备案保证金（机构名称为纯汉字的缴纳2万元，纯英文字母的缴纳5万元）。
4. 行业协会审核通过后，打印《上海市房地产经纪机构备案证明》并盖章，将电子版《证明》发送至申请机构邮箱。

资料填写注意事项：

1. 机构名称：必须和营业执照完全匹配。
2. 备案地址：必须和营业执照地址完全匹配，且能够出示房屋产权证明或房屋租赁合同。
3. 法定代表人：如果公司法人变更，需要带齐资料完成变更手续后才能申请备案。
4. 证件编号：填写营业执照上的统一社会信用代码/房地产经纪机构备案证明编号。
5. 证件类型：选择公司证件或个体工商户证件。
6. 合同或协议：需要填写买卖合同或租赁合同编号，以及对应的金额。

以上流程仅供参考，填写资料时如有疑问，可咨询上海市房地产经纪行业协会。