上海小型饭店申请食品经营许可证的流程和所需资料如下：

流程：

1. 申请企业名称预先核名，在工商局递交《企业名称预先核准申请书》。
2. 取得《企业名称预先核准通知书》后，去食药监递交《食品经营许可证申请书》及一系列申请材料，申请审批。
3. 食药监工作人员在完成食品经营许可证现场核查后，递交资料进行办理。如不具备条件，会将《行政许可不予受理通知书》递交至经营者。
4. 经营者获取食品经营许可证正本、副本。

所需资料：

1. 经营者的身份证原件及复印件。
2. 营业执照法人的身份证原件及复印件。
3. 代理人身份证原件及复印件以及经营者授权委托书。
4. 经营场所证明。
5. 相关设施设备及周边环境卫生条件证明。
6. 食品安全管理人员证件及培训记录。
7. 食品安全管理制度。
8. 委托代理需要提供委托代理人的证明文件。

注意事项：

1. 确保申请的材料真实、完整、合法。
2. 按要求提交申请材料和证件，不要虚假承诺。
3. 在等待审核结果期间，应该耐心等待并按规定时间签收。

以上信息仅供参考，具体流程和所需资料可能因实际情况而有所不同，建议咨询相关部门获取具体信息。