上海申请旅行社业务经营许可证需要准备以下资料和手续：

1. 公司法定代表人签署的《企业设立登记申请书》；
2. 全体股东签署的公司章程；
3. 法人股东资格证明或者自然人股东身份证及其复印件；
4. 董事、监事和经理的任职文件及身份证复印件；
5. 旅行社业务经营许可证申请表；
6. 投资人或负责人的身份证明复印件；
7. 公司住所（经营场所）的产权或使用证明。

具体流程如下：

1. 向相关部门提出设立申请，提供申请书、股东身份证明等材料。
2. 填写申请表，提交相关材料。
3. 提交材料后，等待相关部门进行审核，并办理相关手续。
4. 等待核准，领取《企业名称预先核准通知书》。
5. 完成后续变更业务，如经营范围、地址等。

需要注意的是，申请旅行社业务经营许可证需要符合相关法律法规和规定，保证经营行为合法合规。同时，具体流程和要求可能会因政策变化而有所调整，建议咨询相关部门获取准确信息。