上海新办出版物经营许可证的操作流程及提交材料如下：

1. 申请：企业法人进入上海市文化市场行政执法总队办证大厅提交申请。申请主体jinxian于企业法人，不能委托或代理，同时提供营业执照、企业公章等材料。
2. 受理：申请完成后，会有工作人员进行申请材料的初步审核。如果材料齐全，则可以正式受理。
3. 审查：如果申请材料符合要求，则会有专人进行实地核查，主要目的是确认申请主体是否具备申请资格。
4. 领证：一切审核通过之后，就会颁发出版物经营许可证。

在提交材料时，需要准备以下内容：

1. 《出版物零售企业设立申请登记表》1式3份。
2. 企业章程（需要由法人和股东签字并加盖公章）。
3. 企业的注册资本证明材料。
4. 法定代表人、主要负责人的身份证复印件。
5. 经营场所的地址证明文件（房产证和租赁合同）。
6. 如果是企业自有房产，则填写《自有房产地址申请表》；如果是租赁的，则填写《租赁合同申请表》。

此外，建议申请者应关注时间节点，提前备好相关材料，以免错过。具体情况请以官方提示为准。