上海互联网药品信息服务资格证的申请流程和所需材料可能因政策变化而略有不同，以下是一般的申请流程和所需材料：

申请流程：

1. 准备申请材料：包括公司名称、地址、法定代表人姓名、注册资本、经营范围等。同时需要提供公司的营业执照、法人身份证等必要文件。
2. 向上海市食品药品监督管理局提交申请，并递交相关材料。
3. 等待审核：一般需要经过初审、复审和审批等多个环节，需要耐心等待。
4. 领取证书：如果申请通过，将由工作人员通知领取互联网药品信息服务资格证书。

所需材料：

1. 公司基本情况介绍，包括公司简介、互联网药品信息服务管理人员的简历和业绩；
2. 公司互联网药品信息服务相关制度文件，包括《互联网药品信息服务管理办法》等法律法规；
3. 公司营业执照、法人身份证等必要文件；
4. 互联网药品信息服务的范围、内容及服务方式等说明；
5. 其他相关材料，如工作总结、工作计划等。

需要注意的是，具体的申请流程和所需材料可能会因政策变化而有所不同，建议申请者在进行申请前详细了解相关政策规定，并按照要求准备申请材料。同时，由于申请过程可能涉及多个环节和审批部门，建议申请者提前了解并准备好相关手续和费用。