申请上海互联网药品信息服务资格证需要准备以下材料和步骤：

材料：

1. 《互联网药品信息服务申请表》和《公司/网站信息公示表》；
2. 公司营业执照复印件；
3. 公司简介、机构设置及业务流程；
4. 专业技术人员及相应资格证明材料；
5. 服务器所在地电信主管部门出具的互联网接入服务业务许可复印件；
6. 法定代表人身份证明复印件；
7. 确保网站信息的制度规范文档，如信息管理制度、审核制度、发布管理制度等。

步骤：

1. 提交申请：填写《互联网药品信息服务申请表》和《公司/网站信息公示表》，准备相关材料。
2. 等待审批：药监局对申请材料进行审核，并通过初审和复审。
3. 现场核查：待审批通过后，药监局会发出“现场核查通知”，对经营场地、设备设施、技术人员等条件进行现场核查。
4. 完成审核：现场核查通过后，药监局会发出正式的批准通知，申请人可领取互联网药品信息服务资格证书。

注意事项：

1. 申请材料必须真实有效，如存在虚假信息，将面临处罚。
2. 在网站首页显著位置展示资格证书编号，以便消费者查询验证。
3. 证书有效期为五年，到期需重新申请。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能因各地要求而有所不同，建议咨询相关主管部门或guanfangwangzhan了解具体要求。