新办上海食品经营许可证需要准备以下材料：

1. 原许可证正副本。
2. 营业执照或法人登记证书。
3. 法定代表人、食品安全管理员信息表及身份证复印件。
4. 第三方合同餐饮公司出具的委托书。
5. 经营场所平面布局图。
6. 周边环境图。
7. 相关设施设备清单，其中包含消毒设施、留样设备、废弃物存放设施等。
8. 食品安全管理制度。由食品安全管理机构负责制定，并由法定代表人、食品安全管理负责人签字确认。

准备好材料后，按照以下步骤进行办理：

1. 准备相关材料，前往食药监局提出申请。
2. 食药监局工作人员会对相关材料进行审核，主要审核材料是否齐全、是否符合法定形式，这些材料将会提交给相关专业人员。
3. 专业人员会进行核查，主要核查是否符合开办条件，符合之后将会发放食品经营许可证。

具体可咨询上海食药监局工作人员，希望以上信息对您有所帮助。