上海食品经营许可证的申请条件和指南如下：

申请条件：

1. 具有与经营的食品品种、数量相适应的食品原料处理和食品加工、包装、贮存等场所，保持该场所环境整洁，并与有毒、有害场所以及其他污染源保持规定的距离。
2. 具有与生产经营的食品品种、数量相适应的生产经营设备或者设施，有相应的消毒、更衣、盥洗、采光、照明、通风、防腐、防尘、防蝇、防鼠、防虫、洗涤以及处理废水、存放垃圾和废弃物的设备或者设施。
3. 有食品安全专业技术人员、管理人员和保证食品安全的规章制度。
4. 具有合理的设备布局和工艺流程，防止待加工食品与直接入口食品、原料与成品交叉污染，避免食品接触有毒物、不洁物。
5. 上海市食品药品监督管理部门规定的其他条件。

申请材料：

1. 上海市食品经营许可证申请表。
2. 企业名称预先核准通知书复印件。
3. 法定代表人、负责人或投资人的身份证明复印件。
4. 食品安全专业技术人员登记表及健康证复印件（部分地区可能不需要）。
5. 房产证明或租赁合同复印件（部分地区不需要），租赁合同应经工商部门备案。
6. 企业章程或经营管理制度。
7. 当地检验检疫部门出具的营业执照复印件，上海市行政区域内已获得国家专项许可项目清单，需要一并提供。

申请流程：

1. 受理：窗口值班人员接收申请材料并核验，申请人符合申请资格，并材料齐全、符合法定形式的，予以受理并开具《行政许可申请受理决定书》。申请人不符合申请资格或材料不齐全、不符合法定形式的，接件人员将当场告知申请人或拒绝受理。
2. 审查：自受理许可后，该局审查人员进行现场核查，并对符合条件的出具审查意见。
3. 决定：许可审批负责人对材料进行审核，并对符合条件的颁发许可证。
4. 送达：窗口统一发放《食品经营许可证》。

许可证的换证、变更等相关业务办理请参照上海市场监督管理局官网发布的操作指南。

以上信息仅供参考，更多细节建议咨询上海市食品药品监督管理局官网或电话咨询。