上海企业办理食品经营许可证，需要按照以下步骤准备资料并完成流程。

首先，你应当获取申请表并填写。其次，要向相关部门提出申请，并递交相关资料，具体包括：

1. 营业执照复印件；
2. 食品安全管理制度文本；
3. 申请人明（身份证或企业法人营业执照）；
4. 符合相关规定条件的食品安全管理人员培训证明复印件；
5. 申请食品经营许可新办的，提供经营场所位置图、平面布局流程图；
6. 申请网络食品经营的，提供与第三方平台签订的合同。

然后，相关部门在收到申请后，会进行初步审查。主要流程包括：

1. 检查申请书及附件是否符合要求；
2. 受理申请并审查申报材料是否齐全、符合法定形式；
3. 组织现场审查验收；
4. 根据现场审查情况作出行政许可决定。

在所有流程走完之后，相关部门会颁发食品经营许可证。具体的办理流程和时间可能会根据各个区的规定略有不同，因此建议具体查询当地相关部门的申请条件和流程。另外，也可以直接到相关部门进行咨询。

以上步骤仅供参考，具体办理事宜应以当地政府食品药品监督管理部门的规定为准。