上海新设商业特许经营备案的流程和所需资料如下：

流程：

1. 提出申请：将商业特许经营备案申请提交给商务主管部门，并填写申请表。
2. 受理申请：商务主管部门审查提交的申请材料，材料齐全且符合法定形式，会予以受理。
3. 审核材料：商务主管部门对材料进行审核，需要补充的，会告知申请人补正。
4. 备案公示：审核通过后，会进行商业特许经营企业备案公告并公示企业备案信息。

所需资料：

1. 商业特许经营企业基本资料：企业注册资料，营业执照复印件，组织机构代码证复印件。
2. 特许经营合同及商业资源资料：包括特许经营总体合同、特许经营业务合同、业务培训合同及各加盟店之间的区域授权合同等。
3. 投资风险和财务分析资料：包括财务报告和企业章程等。
4. 其他相关资料：企业简介、组织结构图、各部门职能、项目简介、市场计划、竞争分析、广告计划等。

 

以上信息仅供参考，具体流程和所需资料可能会因为上海不同区域的具体要求而有所不同，建议咨询相关部门获取详细信息。