上海商业特许经营备案申请的条件和流程资料如下：

条件：

1. 拥有两个以上的直营店，并且成功经营一段时间。
2. 拥有商标、专利和注册商标。
3. 有符合法律规定的特许经营资质证明。
4. 按照中华人民共和国商业特许经营办法的规定，需要进行备案，且应提供特许经营合同。

流程：

1. 准备相关文件，包括商务部统一制定的表格和所需的其他材料。
2. 向上海市商业特许经营协会提交申请并登记，该协会网站提供了提交申请和登记的在线平台。
3. 特许人所在地商务主管部门进行形式审查和初审。
4. 上报国家商务部并等待审核结果。

所需资料：

1. 商业特许经营合同。
2. 特许人的营业证明。
3. 商标注册证书或其他标识特许人拥有知识产权的材料。
4. 特许人的企业法人营业执照。
5. 特许人的最近经会计师事务所审计的财务会计报告。
6. 直营店证明及经营情况资料。
7. 其他需要提交的文件。

以上信息仅供参考，具体流程和所需资料可能会因为实际情况而发生变化。