新办上海二类医疗器械经营备案的流程和申请条件如下：

流程：

1. 准备相关材料，包括营业执照复印件、填写并提交二类医疗器械经营备案表等。
2. 向所在地市场监督管理局提出备案申请。
3. 等待市场监督管理局的审核。
4. 审核通过后，即可领取二类医疗器械经营备案证明。

申请条件：

1. 企业有明确的经营范围，包括二类医疗器械的经营项目。
2. 企业有合适的场所，包括办公经营场所，且符合相关的消防安全等要求。
3. 企业有合格的销售人员，能够提供相关销售人员培训和资质证明。
4. 企业有完善的售后服务体系，能够提供售后服务和产品召回等措施。
5. 符合相关法规和政策要求，不存在违法违规等情况。

总的来说，新办上海二类医疗器械经营备案需要准备相关材料，向所在地市场监督管理局提出申请，并按照流程进行备案和审核。在申请时，企业需要确保符合相关申请条件，以确保备案的顺利通过。