上海二类医疗器械经营备案办理需要的材料如下：

* 《第二类医疗器械经营备案表》电子版（加盖公章）。
* 营业执照复印件加盖公章。
* 法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明复印件（核对原件）。
* 经营场地、仓库场所的证明文件，租赁合同复印件（核对原件）等。
* 经营设施、设备的证明文件。
* 组织机构框架、岗位职责、质量管理制度、工作程序等材料。

详细流程如下：

1. 找到一家有备案资质的第三方机构，如药企第三方登记备案平台。
2. 按照机构要求填写并提交《医疗器械经营企业备案申请表》等文件。
3. 提交相关材料，如身份证和复印件、企业名称和申请表等。
4. 等待第三方机构审核，一般需要3-4个工作日。
5. 材料审核后，如果符合要求，将获得一个加盖红章的《医疗器械经营许可证》。

完成上述流程后，即可成功办理二类医疗器械经营备案。具体操作时若有疑问，可咨询相关专业人员。