针对办理医疗器械三类经营许可证遇到的问题，我们通过实地调研和案例分析，总结出以下解决问题的方法：

详细了解办理许可证所需资料和流程：了解许可证的申请材料、办理时间、费用等信息，以及审批流程和具体要求。

合理安排申报时间：根据所需资料的准备情况和审批周期，合理安排申报时间，以避免延误。

准备完整、准确的申报资料：认真核对申报资料，确保完整、准确无误，以提高审批通过的概率。

与相关部门及时沟通：在申报过程中，与相关部门保持紧密联系，及时解决问题和答疑。

办理医疗器械三类经营许可证的工作流程包括以下几个步骤：

准备申请材料：根据相关要求准备申请材料，包括企业法人营业执照、经营许可证、产品质量保证书等。

填写申请表格：根据要求填写申请表格，包括企业基本信息、经营范围、产品信息等。

提交申请材料：将准备好的申请材料提交给相关部门，缴纳相应的申请费用。

资格审查和现场检查：相关部门将对申请材料进行资格审查，并进行现场检查。

许可证颁发：通过资格审查和现场检查合格后，相关部门将颁发医疗器械三类经营许可证。

问：医疗器械三类经营许可证办理需要多长时间？

答：办理时间主要取决于申报资料的完善程度、审批流程以及部门工作效率。一般情况下，办理医疗器械三类经营许可证需要1-3个月的时间。

综上所述，办理新设上海医疗器械三类经营许可证的过程需要详细了解申报资料和流程，合理安排申报时间，准备完整、准确的申报资料，并与相关部门保持沟通。通过以上方法和工作流程，可以更加顺利地办理医疗器械三类经营许可证。